Časopis ženských lékařů G Y N E K O L O G - www.gyne.cz - email: info@gyne.cz
Monitorování
asistované reprodukce a reprodukční medicíny pomocí Internetu
Bourek, A., Žižka, J., Ventruba, P., Frey, L.
Biofyzikální
ústav (zdravotnická informatika) LF MU, Joštova 10, 602 00 Brno.
I. gynekologicko - porodnická klinika LF MU, Obilní trh 11, 656 77 Brno
klíčová slova: neplodnost, asistovaná reprodukce, Internet, zdravotnická informatika, data mining, knowledge management
Souhrn:
Předkládáme metodiku a nástroje k prohledávání zdrojů medicínských
informací dostupných pomocí Internetu. Jde zejména o aktivní vyhledávání
s využitím vyhledávacích služeb, seznamů, portálů, specializovaných
on-line databází a medicínských elektronických přehledů a pasivní příjem
informací prostřednictvím síťových novin a diskusních skupin. Uvádíme
podrobný přehled zdrojů se vztahem k reprodukční medicíně a asistované
reprodukci. Získané elektronické dokumenty vyhodnocujeme počítačovou analýzou.
Počítačové
sítě umožňují rozsáhlý přístup k informacím stále narůstajícímu počtu
uživatelů. Internet a zejména WWW ovlivňuje v posledních letech stále více
jak laickou veřejnost, tak profesionální zdravotníky. Pomocí vyhledávacích
služeb a nástrojů vyvíjených ve spolupráci s Fakultou informatiky MU se
pokoušíme popsat současnou úlohu Internetu pro sledování rozvoje asistované
reprodukce a diagnostiky a léčby poruch plodnosti.
Materiál
a metodika
Hrubé
členění výsledků prohledání WWW obecně orientovanými vyhledávacími
službami přineslo množství informací komerčního zaměření směřovaného
zejména na laickou veřejnost. Z medicínského hlediska a hlediska profesionálního
pracovníka zabývajícího se asistovanou reprodukcí jsou daleko cennější
informace získané použitím specializovaných vyhledávacích programů
(agentů). K automatizovanému prohledávání využíváme programy
Copernicus2000, IforianQuest a WebCompass. V off-line režimu poté
vyhodnocujeme nalezené zdroje a následně monitorujeme převážně ty, které
poskytují informace pro lékaře zabývající se poruchami plodnosti a
technologiemi asistované reprodukce (ART). Opakované prohledání WWW s použitím
klíčových výrazů získaných při předchozím vyhledávání a užitím
problémově orientovaných vyhledávacích služeb nám umožňuje daleko
podrobněji monitorovat dokumenty s tématikou neplodnosti a ART uložených v
distribuovaných archivech Internetu.
1.
KLASICKÉ ZDROJE MEDICÍNSKÝCH INFORMACÍ
Získávání,
přenos a zpracování informace je jednou z nejdůležitějších složek všech
oborů , ve kterých se uplatňuje lidský intelekt. Má-li se gynekolog podílet
na takové úrovni péče o nemocného, která odpovídá současným možnostem,
musí nejenom pracovat se stále větším množstvím informací, ale také je
vhodně kombinovat a na jejich základě přijímat patřičná rozhodnutí.
Postupem doby si musí vypracovat systém monitorování oblastí svého medicínského
zájmu. Cílem tohoto sdělení je snaha nastínit současné možnosti využití
elektronicky dostupných textů ke sledování tak dynamické součásti
gynekologie, jakou je asistovaná reprodukce a léčba poruch plodnosti. Většina
z nás má svůj způsob jak se udržet v rámci své specializace “v
obraze“. Množství užívaných přístupů svědčí o tom, že každý má
jisté přednosti, ale současně i nedostatky. Žádný z nich sám o sobě
nestačí a je třeba je mezi sebou kombinovat. Jedná se o konference, semináře
a neformální setkání, kde dochází k osobní interakci lékařů.
Přehledné
zdroje medicínských novinek a trendů nacházíme v periodicích typu Remedia,
Medicína, Zdravotnické noviny, Tempus medicorum, Causa Subita, Postgraduální
medicína, JAMA, Nature Medicine, BMJ, Lancet, The New England Journal of
Medicine a podobných. Specializované časopisy publikují články z celého základního
oboru jako například Gynekolog, Česká gynekologie, Praktická gynekologie,
Current Opinion in Obstetrics & Gynecology, Obstetrics and Gynecology, AMJOG,
International Journal of Gynecology & Obstetrics, European Journal of
Obstetrics &
Gynecology and Reproductive Biology, Archives of Gynecology and Obstetrics,
Clinical Obstetrics and Gynecology, Zentralblatt fur Gynäkologie, Surgery
Gynecology, and Obstetrics.
Dále
máme k dispozici časopisy zaměřené na vlastní problematiku asistované
reprodukce a reprodukční medicíny: Fertility and
Sterility, The Journal of Reproductive Medicine, Human Reproduction,,
International Journal of Andrology, Clinical Endocrinology a další.
Výpis
běžně dostupných periodik z oboru gynekologie a porodnictví i s jejich
impaktními faktory lze nalézt na průběžně aktualizované stránce Národní
lékařské knihovny www.nlk.anet.cz/czech/casopis/spoluprace/obstgyn.htm. Nejběžněji
používaná gynekologická periodika lze prohledat pomocí upraveného rozhraní
Medline pro gynekology na www.medplaza.com/medline/gyn.php3. Rozsáhlé přehledy
vycházejících periodik lze nalézt na wwwlib.murdoch.edu.au/find/abs/uncover1.txt
a dalších, abecedně řazených stránkách tohoto odkazu.
Dobrá
klinická praxe vyžaduje nepochybně vyváženou kombinaci klinické zkušenosti
a znalosti aktuálních ověřených poznatků - medicíny podložené důkazy
(Evidence Based Medicine – EBM). Orientace v hierarchii vědeckých
hodnot informací je pro lékaře v praxi často velmi obtížná a stejně tak
může být obtížná volba odborného postupu. Gynekolog potřebuje znát názory
na aktuální diagnostické a léčebné postupy, ale zpravidla nemá čas pátrat
v odborné literatuře a ověřovat si všechny nové informace hledáním důkazů.
Hledá oporu v autoritě. Lékař má i svoji klinickou zkušenost, která je
pro něj v řadě situací rozhodující pro volbu postupu. Vzniklé dilema je těžko
řešitelné bez nástrojů nabízených zdravotnickou informatikou. Je však třeba
těmto nástrojům rozumět, aby míra jejich užitku mohla být co největší.
Racionalita takového přístupu nutí svědomitého lékaře k vytvoření
strategie vyhledávání a shromažďování dat, převážně elektronických
textů. Současně nutí k jejich uspořádání na vlastním PC do formy, která
umožňuje posléze rychlé vyhledání relevantních podkladů pro řešení
specifického problému neplodného páru v reálném čase při jejich návštěvě
v ambulanci. Možností získat elektronické dokumenty se vztahem k neplodnosti
a metodám ART se nabízí hned několik.
2.
MEDICÍNSKÉ ELEKTRONICKÉ PŘEHLEDY VŠEOBECNÉHO CHARAKTERU
V
české části WWW je možné nalézt všeobecné medicínské přehledy na
adresách:
a)
- zde naleznete stránky nakladatelství Panax. Obsahují: Aktuálně ze
zdravotnictví včetně archivu zpráv od února 1999, Novinky z medicíny,
Odkazy na Odborné společnosti, Odborné akce. To vše je zpřístupněno pomocí
plnotextového prohledávání.
b)
společnosti EuroNet CZ s odkazy na odborné časopisy ČLS JEP s přístupem
do abstrakt jednotlivých článků od začátku r. 1999, přehledně uspořádanými
zdravotnickými zdroji v ČR – knihovny, komory, LF, nemocnice, státní správa,
odborné společnosti, pojišťovny a seznamem diskusních skupin (omezený
rozsah příspěvků).
c)
www.newsdart.com
- instalací freewarového produktu NEWSDART získáte osobního asistenta pro
prohledání novinových zpráv pomocí Internetu (prohledání vybraných
zpravodajských serverů na základě vámi zadaného klíčového slova či spuštěním
uloženého profilu). Dokáže pátrat jak v titulcích, tak v celých článcích.
Při zaměření na určitou oblast tento pomocník rychle zkontroluje světový
tisk. Jakmile nalezne vhodný text, nabídne vám jej v malém okně na pracovní
ploše. Odkaz můžete buď navštívit svým prohlížečem, nebo smazat. Součástí
nastavení je i časový interval v jakém má program zdroje kontrolovat.
3.
AKTIVNÍ VYHLEDÁVÁNÍ INFORMACÍ
a)
Vyhledávací služby
Komerční,
všeobecně orientované vyhledávače nemohou poskytovat konzistentně
relevantní odkazy vzhledem k objemům dat, které indexují a rozmanitosti uživatelů,
kteří k nim přistupují. Vytipování zdrojů je, pokud pomineme případ, že
nám adresu (odborně též nazývanou universal resource locator -URL ) někdo
osobně doporučí, prakticky vždy spojeno s rešeršní aktivitou. K rešerši,
která je závislá na kvalitně zvolených klíčových slovech, frázích a
jejich vhodné kombinaci, je v současnosti k dispozici několik softwarových nástrojů.
Strategie volby klíčových pojmů je v tomto případě poněkud odlišná od
strategie užívané při prohledávání obsahu stránek World Wide Webu (WWW).
Je třeba myslet na to, že nepátráme po konkrétních spojeních (např.
“ovariální stimulace“), ale že se snažíme vyhledat zdroje pokrývající
celou širší oblast. Zvolíme tedy za základ rešeršního spojení například
infertil* OR neplodn*. Při pouhém zadání takového dotazu vyhledávači
bychom byli donuceni postupně on-line navštívit nalezené URL. Částečně
je možné, alespoň pro první pokus, využít služby
, která automaticky vytvoří z nalezených odkazů klastry (z anglického
cluster), tj. shluky tématicky příbuzných dokumentů. Shluky nesoucí označení
např. “directories“ nebo “resource lists“ jistě stojí za probádání.
Efektivnější
je však užití tzv. internetových agentů. Programů, které víceméně
automaticky po instalaci v PC provedou následné úkony:
a)
Předají váš dotaz paralelně celé skupině vyhledávačův
Internetu.
b)
Postupně z navštívených URL stáhnou a přehledně shrnou základní
údaje (např. počet hypertextových odkazů, počet obrázků, klíčová
slova dané stránky apod.).
c)
Získané URL oklasifikují podle relevance a ošetří duplicitní
odkazy.
d)
Setříděné odkazy nabídnou k off-line prohlížení.
Jde
o ”správce znalostí”, které lze nakonfigurovat, aby v předdefinovaných
intervalech automaticky rešerši provedly a shrnuly výsledky. Umožňují
prohledat vyhledávače, Gophery a FTP servery, případně databázové zdroje
různých organizací. V principu provedou rešerši Internetu a předloží ji
formou seznamu. Většinou ve formátu hypertext markup language (HTML) s aktivními
odkazy. Z něj si může uživatel vytipovat URL, které se formálně tváří,
že by mohly odpovídat jeho zájmům a potřebám a ty posléze jednoduše
poklepem tlačítka myši navštívit a zhodnotit jejich obsah. Lze užít vzájemně
si velmi podobné freewarové produkty Copernic2000 (www.copernic.com) a
BullsEye Manager nebo totéž přímo od tvůrce, společnosti Intelliseek . Copernic2000 i BullsEye 2 Pro je možno koupit jako komerční
verze. I freewarové verze se však automaticky přihlásí a paralelně prohledávají
AltaVistu, EuroSeek, Excite, Fast Search, Google, HotBot, Infoseek, Lycos,
Magellan, Netscape Netcenter, Open Directory Project a WebCrawler. Dalším
komerčním softwarem je například Inforian Quest -. www.inforian.com. Omezená
použitelnost původních vyhledávacích služeb a výrazná potřeba objektivních
nástrojů poskytujících dobře organizovaný, uniformní a integrovaný přístup
k informacím vede ke tvorbě virtuálních knihoven a míst s kategorizovanými
odkazy. I přes stále se zdokonalující postupy strojového učení a umělé
inteligence (hojně užívané novějšími vyhledávači – např. GOOGLE
) se nelze obejít bez expertních služeb knihovníků a redaktorů. Ti stojí
v pozadí jak tradiční tvorby katalogů v knihovnách (cca 1 hodina času potřebného
k vytvoření jednoho záznamu) nebo tzv. minimálního indexování (užívaného
v případě virtuální knihovny YAHOO!
), kde je každému hodnocení záznamu věnována 1 minuta, nebo vynikajícího
českého vyhledávače SEZNAM (www.seznam.cz). Pro specificky vyhraněnou obec
uživatelů plní nedocenitelné služby akademické virtuální knihovny jako
je INFOMINE na http://infomine.ucr.edu.
b)
Portály
Špičkový
přístup k relevantním a hodnotným datům poskytují specializované
zdravotnické portály. V doméně české jsou to www.mednet.cz a www.medical.cz,
z cizích například www.medscape.com. Schopnost specifikovat obsah a zdroje tématu
pravděpodobně zůstane v rukou expertů / knihovníků. Je však dnes již značně
posílena “inteligentním“rozšiřováním sbírek za pomocí automatů (Web
crawling – prolézání Webu pomocí programových pavouků), kategorizací
zdrojů (strojovou klasifikací a indexací) a softwarově podpořenou údržbou
URL a sbírek / seznamů (automatické hlídání aktualizace dokumentů).
Právě
takové zdroje je třeba využívat pro tzv. “custom subject searching“
(prohledávání individualizovaného tématu) nebo k “domain focused
searching“ (vyhledávání ze specifické domény), případně k dlouhodobějšímu
monitorování specifické oblasti zájmu. Výše uvedený “doplňkový“ způsob
práce s Internetem většinou vyžaduje vynaložení značné iniciální námahy
s vyhledáním jak vlastních nástrojů pro monitorování, tak i k sestavení
a periodické údržbě uživatelských profilů. Ty se samozřejmě budou lišit
od nástroje k nástroji. Jednou to bude pouhé zadání oblasti zájmu (např.
infertilita), jindy vydefinování specifického medicínského oboru (asistovaná
reprodukce) a v neposlední řadě se bude jednat o profily sestavené pomocí
booleovských operátorů (AND, OR, NOT, NEAR apod.). Lékař si vytvoří svůj
specifický “profil“u nalezených a zvolených služeb poskytovaných v Internetu,
a ty buď periodicky sám spouští, nebo nastaví interval jejich automatické
aktivace.
c)
Specializované databáze
Prohledávání
veřejně přístupných specializovaných databází je dnes již běžné.
Gynekologové nejčastěji využijí týdenní
bibliografie biomedicínské literatury (Current Contens), bibliografie pro rešeršní
práce ve zdravotnictví (Medline) http://igm.nlm.nih.gov/
případně
na Dr. Felix's Free MEDLINE Page (www.beaker.iupui.edu/drfelix/), specializované
databáze o problematice syndromu získané imunodeficience (AIDS Update), o lécích
(AMA/NET Drug Evaluation), o epidemiologii nebo nových trendech
(CDC Information Service). Volně přístupná databáze COCHRANE REVIEW
ABSTRACTS na serveru MEDSCAPE v sekci http://Library.medscape.com umožňuje práci
s Cochrane Clinical Trial Review Abstracts. Přehledy pracovní skupiny Cochrane
shrnují a analyzují výsledky kvalitních výzkumů. Jedná se o excelentní přehledy
množství léčebných protokolů a jeden z nejrespektovanějších zdrojů EBM.
4.
PASIVNÍ PŘIJÍMÁNÍ INFORMACÍ
Další
možností je pasivní přijímání informací jednou vytvořeným kanálem –
pomocí:
(a)
newsletters (síťové noviny)
Z
hlediska ART jsou nejzajímavější www.ferti.net Ferti.Net Magazine - čtrnáctidenník
s posledními novinkami ART. Jako zdroje využívá on-line media, lékařské
databáze, originální tiskové články, novinové články, rozhlasová
zpravodajství a peer-reviewed publikace a Embryology Conference na www.ivf.net,
kde byl také v nedávné době k nalezení elektronický formulář k vyplnění
o laboratorních postupech v IVF. Dobrou představu o tom, co ostatní považují
za správné je i prolistování, případně vyplnění takovýchto dotazníků.
Síťové noviny často upozorní na další kvalitní odkazy. Na URL www.obgyn.net/infertility/articles
lze z poslední doby nalézt například: Feature Article of the Month: Human
Oocyte and Embryo Cryopreservation, How
To Appraise Clinical Trials On The Internet - A Layman's Guide, Getting
Pregnant - A Guide For The Infertile Couple, Infertility
Glossary Of Terms, Pregnancy
Loss: Approaches to Evaluation and Treatment a další články. Journal
Scan – Women’s
Health (http://womenshealth.medscape.com/17782.rhtml)
stručně předkládá novinky z Obstetrics and Gynecology, American Journal of
Obstetrics and Gynecology, JAMA, The New England Journal of Medicine, The
Lancet, The American Journal of Public Health, and Cancer. Centers
for Disease Control and Prevention Division
of Reproductive Health (CDC). Obsahuje mimo jiné americký registr
asistované reprodukce na (http://www.cdc.gov/nccdphp
/drh/arts/introduc.htm). Americká The Society for Assisted Reproductive
Technology (SART), shromažďuje údaje a publikuje každoroční přehledy úspěšnosti
center ART v USA a Kanadě od roku 1989. V roce 1992 americký Kongres schválil
povinnost pro CDC zveřejňovat roční přehledy dosažených těhotenství po
výkonech asistované reprodukce. Množství další odborných podkladů lze získat
na URL http://ncbi.nlm.nih.gov, http://womenshealth.medsca-pe.com, http://humrep.oupjournals.org,
AMJOG na
podklady a materiály American Society for Reproductive
Medicine (ASRM) na http://www.asrm.org (pro představu například dokumenty
o vyhláškách ve vztahu k asistované reprodukci v USA, použití fetálních
oocytů v asistované reprodukci, využití computer-enhanced ultrazvuku k předvídání
receptivity endometria, minimální standardy pro ART podle ASRM, diskuse o
budoucnosti ART a mnoho dalších.
(b)
newsgroups (diskuzní skupiny) & list discussions (diskusní poštovní
seznamy)
Periodicita
doručovaných textů, určena samotnou podstatou využité služby, závisí na
množství příspěvků. Poštovní seznamy zároveň velmi dobře poslouží k
obstarání “rádců“, kolegů ochotných diskutovat o čemkoliv se vztahem
k ART. Je pravidlem, že s narůstající vzdáleností mezi diskutujícími narůstá
přímo úměrně míra otevřenosti.
Z
listů je zajímavý například “reproendo“ – Society for the Study of
Reproduction, přihlášení – majordomo@world.std.com , jde o diskuzi
moderovanou, obsahuje archivy, kontaktní osobou je Dr. Richard Rohan rrohan@
world.std.com , tématicky se jedná o Life Sciences->
Biologii -> specificky o reprodukci.
5.
VÝSLEDKY
1.
Od roku 1997 monitorujeme aktivně zdroje dostupné v Internetu se vztahem k
problematice asistované reprodukce a neplodnosti. Za toto období archivujeme přes
100 MB článků z výše uvedené tématiky a čtvrtinový objem samotných
citací, případně citací s anotacemi. Materiál v budoucnu poslouží k
takzvanému trend – tracking, vyhodnocování přesunu preferencí a zájmu o
určité diagnostické a terapeutické prostředky a postupy v čase.
2.
Od roku 1999 budujeme “příruční textový soubor“ s výstřižky nejzajímavějších
poznatků pro rychlou orientaci v tématice ART. Ten ve své prosté textové
verzi představuje dvousetstránkový kompilát citací s jedno až desetiřádkovým
komentářem. Jsme přesvědčeni, že veškeré medicínské aktivity jsou
zbytečné, pokud nejsou široce sdílené. Proto v této práci předkládáme
prameny dostupné pomocí Internetu, které se nám podařilo nalézt a které
se nám zdály pro naší práci nevhodnější.
3.
Protože se v případě knowledge-miningu (dolování informací) a knowledge
managementu (správě informací) v Internetu jedná o dynamický děj, jsou možnosti
prezentace formou článku velmi omezené. Vzhledem k numerickému počtu odkazů
i složení uživatelů Internetu jsme přesvědčeni o narůstajícím významu
tohoto média jak pro laickou veřejnost (lidé s reprodukčními problémy),
tak pro odbornou lékařskou veřejnost.
4.
V práci, která má dlouhodobý charakter, monitorujeme posuny a trendy v
Internetu se vztahem k problematice neplodnosti a asistované reprodukce.
Smyslem práce je poskytnout zdravotníkům z domény asistované reprodukce nástroj
umožňující elektronické sledování informací ve specifické oblasti
jejich zájmu. Pomocí specifických nástrojů pro shlukování a námi vyvinutého
programu pro textovou klasifikaci (TEA klasifikátor, autor L. Frey, J. Žižka)
je možný i pohled na složení získaných elektronických textů. V roce 1999
byly nejfrekventnější KATEGORIE: ovariální stimulace / hyperstimulace,
kryokonzervace, gonadotropiny, ICSI, pregnancy rates, mužská neplodnost
TÉMATA:
etika asistované reprodukce, klonování, kryoprezervace (oocyty, ovariální
tkáň), hCG priming, acetylosalicylová kyselina, metformin, stress – délka
cyklu – infertilita, molekulární úroveň lidské reprodukce, OHSS, GnRH
antagonisté, transfer jednoho embrya, transvaginální aplikace progesteronu,
ICSI (mikrodelece Y chromozomu), morfologie spematozoí, ko-kultury, kultivační
média, kultivační podmínky, UTZ vyhodnocování echogenity endometria.
ZÁVĚR
Pokud
nemá uživatel připojení do počítačové sítě pevnou linkou, většinou
je odkázán na zdroje a nástroje doporučené buď kolegou nebo literaturou.
Pomalejší připojení (komutovanou linkou) neskýtá dostatek prostoru k nalézání,
detailnějšímu odzkoušení nebo ke stažení některých nástrojů vhodných
pro kontinuální medicínské sebevzdělávání. Bez takovéto specializace směrem
do vlastního oboru však lékař
ztrácí svou roli inteligentního průvodce ve zdravotním systému. Každý
nemocný, jen trochu zručnější v zacházení s nástroji Internetu, by mohl
mít nakonec větší přehled o problému, než lékař sám.
Na
základě tříletého sledování vývoje v této oblasti se domníváme, že
sledování elektronických zdrojů informací je perspektivní a efektivní nástroj
sloužící v procesu kontinuálního profesionálního rozvoje – dříve nazývaného
kontinuální vzdělávání.
Literatura:
1.
Cooley, R., Bamshad, M., Jaideep, S.: Web Mining: Information and Pattern
Discovery on the World Wide Web, 1997. URL: http://www-sers.cs.umn.edu/~mobasher/webminer/survey/survey.html
2.
Kautz, H., Selman, B.: The Hidden Web, AI Magazine, volume 18, number 2 (Summer),
p. 27, 1997.
3.
Kubica, J. Internet Efektivně. CCB. Brno, 1997. URL:
4.
Lynch, C.: Searching the Internet. In: Scientific American, 3, 1997. URL:
http://www.sciam.com/0397issue/0397lynch.html
5.
Webster, K., Paut, K.: Beyond Surfing: Tools and Techniques for Searching
the Web, 1996. URL: http://magi.com/~mmelick/it96jan.htm
Use
of the Internet for monitoring trends in assisted reproduction and reproductive
medicine
Bourek,
A.,
Žižka, J., Ventruba, P., Frey, L.
Dept.
of Biophysics (Medical Informatics), Medical Faculty, Masaryk University, Joštova
10, 602 00 Brno. Ist Dept. Gynec. Obstet., Medical Faculty, Masaryk University,
Obilní trh 11, 656 77 Brno, Czech Republic (bourek@med.muni.cz)
keywords:
infertility, assisted reproduction, Internet, medical informatics, data mining,
knowledge management
Summary:
We present methods and tools useful for Internet medical data mining. Use of
active knowledge searching by accessing search engines, directories, portals,
specialized on-line databases and medical resources lists as well as passive
information flow generated by newsletters and mailing-lists is covered in detail
for reproductive medicine, assisted reproduction and infertility management.
Acquired electronic documents are further managed using computer aided text
analysis.